江口萝卜猪STAT3基因第16外显子多态性及其与肉质性状、基因表达量的相关性分析

China Animal Husbandry & Veterinary Medicine(2020)

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摘要
为研究江口萝卜猪信号传导及转录激活因子3 (signal transducers and activators of transcription 3,STAT3)基因与肉质性状之间的关系,本试验测定了105头江口萝卜猪11个主要肉质性状指标,构建混合DNA池测序筛选SNP位点,单个样本直接测序验证和基因分型,并检测了不同基因型个体背最长肌中STAT3基因的表达量,利用生物统计软件分析了SNP位点与肉质性状和基因表达量之间的相关性.结果 显示,在STA T3基因第16外显子上检测出1个SNP位点(Exon16-C+ 78T),单个样本测序只发现了CT和TT两种基因型,群体遗传参数分析发现T为优势等位基因,多态信息含量表现为中度多态,x2检验发现该位点显著偏离了Hardy-Weinberg平衡.相关性分析发现,江口萝卜猪TT基因型大理石纹评分和熟肉率均显著高于CT基因型(P<0.05),且TT基因型剪切力显著低于CT基因型(P<0.05);TT基因型江口萝卜猪背最长肌中STA T3基因表达量显著高于CT基因型(P<0.05).在一定范围内,江口萝卜猪STA T3基因表达量的提高可能对于肉质性状的改善具有积极作用,TT基因型个体相较于CT基因型个体STAT3基因的表达量更高,肉质性状表现也更好.研究结果证明,STAT3基因可以作为辅助江口萝卜猪选育的候选基因,Exon16-C+78T可能是影响猪肉质性状的重要SNP位点.
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