杜洛克猪HLCS基因多态位点与生长发育性状的相关性分析

本研究旨在明确羧化全酶合成酶(holocarboxylase synthetase,HLCS)基因突变与杜洛克猪生长发育性状的相关性.利用Illumina SNP60芯片测序结果研究HLCS基因的突变位点,分析突变位点的多态性信息、突变位点与生长发育性状的关联性及突变位点的单倍型.结果 显示,杜洛克猪HLCS基因具有4个SNPs位点:Ssc13:200455646 T＞C、Ssc13:200458655 G＞C、Ssc13:200504530 G＞T、Ssc13:200551864 T＞G,均符合Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05),呈现中度多态性.关联分析结果发现,Ssc13:200455646 T＞C位点TT基因型100 kg背膘、剩余采食量均显著高于TC和CC基因型(P＜0.05);Ssc13:200458655 G＞C位点GG基因型个体100 kg背膘、剩余采食量均显著高于CG和CC基因型(P＜0.05);Ssc13:200504530 G＞T位点GT基因型平均日采食量、平均日增重均显著高于TT基因型(P＜0.05),GT基因型个体100 kg日龄显著小于TT基因型(P＜0.05);Ssc13:200551864 T＞G位点TG基因型平均日采食量、平均日增重均显著高于GG基因型(P＜0.05),TG基因型个体100 kg日龄显著小于GG基因型(P＜0.05);其余性状各位点不同基因型间无显著差异(P＞0.05).Ssc13:200455646 T＞C和Ssc13:200458655 G＞C位点呈现高度连锁,Ssc13:200504530 G＞T与Ssc13:200551864 T＞G位点呈现高度连锁.结果 表明,HLCS基因4个SNPs位点的多态性与杜洛克猪的剩余采食量、平均日采食量、平均日增重、100 kg日龄和100 kg背膘均具有显著相关性,可为猪的生长发育遗传改良奠定基础.