猪繁殖与呼吸综合征病毒5'非翻译区一顶端茎环结构是病毒复制转录必需的顺式作用元件

猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus，PRRSV）基因组5'非翻译区(untranslated region，UTR)对病毒复制转录等生物合成过程至关重要，但其作用机制尚不清楚。本实验室分别在北美型（pAPRRS)与欧洲型PRRSV（pSHE)感染性克隆骨架的5' UTR与ORF1之间插入碱基”at”形成Nde I位点，构建了两个突变体pTLNd4和pSHEnde。结果显示插入后的碱基未影响病毒感染性。以两株突变体为骨架将两株感染性克隆的5' UTR互换，构建了突变体克隆pTLV8和pSHSP5。结果表明pTLV8仍具有感染性，而pSHSP5株拯救出病毒。对pSHSP5和pTLV8的RNA二级结构预测结果显示，虽然嵌合突变体pTLV8的5'端与亲本pAPRRS的二级结构差异较大，但转录调控序（transcription-regulating sequence, TRS）仍位于顶端茎环结构最突出的位置，并保证了TRS与ORF1之间的起始密码子AUG位于该茎环结构的顶端，而pSHSP5的顶端茎环结构则遭到了破坏。本研究结果表明TRS所在的顶端茎环结构在调控病毒复制转录过程中是关键的顺式作用元件之一，对其结构破坏的突变体将不能拯救出病毒。