虎源副流感病毒5型的分离鉴定及全基因序列分析

本研究旨在了解虎源副流感病毒5型(parainfluenza virus 5,PIV5)的遗传变异情况,阐明其基因组与遗传进化等特征.从广东省某动物园疑似虎PIV5感染的病料处理后接种Vero细胞并通过一系列的鉴定,将分离的毒株命名为HMZ.根据GenBank中PIV5基因序列,设计包含全长的12对特异性引物,并扩增其全基因组.将扩增产物克隆到pMD-18T载体上,对鉴定为阳性的重组质粒送检测序,并对基因全序列进行同源性分析及遗传进化分析.结果显示,HMZ与各病毒株全基因序列同源性为97.2％～99.8％.其中与1168-1 (KC237064.1)、ZJQ-221 (KX100034.1)以及Mammalian rubulavirus 5(KY685075.1)亲缘性最高,为99.8％;而与D277的亲缘性最低,为97.2％.全基因系统进化树分析结果表明,HMZ与ZJQ-221、Mammalian rubulavirus 5属于同一分支.