青脚麻鸡L系脾脏发育性状的全基因组关联分析
Animal Husbandry & Veterinary Medicine（2020）
摘要
脾脏是家禽重要的免疫器官.本研究选取70日龄纯系公母鸡各150只,利用重测序技术获取基因组高密度SNP信息,通过全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)挖掘影响解析青脚麻鸡配套系父本纯系(L系)脾脏重和脾脏率的相关候选基因.研究发现,脾脏重和脾脏率的遗传力分别为0.28和0.32,脾脏率较脾脏重有更大的变异.基于单变量混合线性模型,利用质控后的7 882 695个高质量位点进行全基因组关联分析,发现7和9个SNP位点分别与脾脏重和脾脏率显著相关,位于1、2、4、10和26号染色体.对显著SNP位点进行注释,共筛选到MTMR2、CEP57、IL16和LGR6等11个可能与脾脏发育有关的候选基因.
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