黑龙江省某规模化牧场BVDV病毒分离鉴定及生物学信息分析

为了探讨黑龙江某规模化牧场发病奶牛的致病原及其生物学特征,对黑龙江省某规模化牛场采集到的育成牛肺脏组织样本进行病毒分离鉴定,确定了样本的基因型为BVDV-1d,5'UTR的同源性比对显示,与中国北京株BJ1023(Genbank:KF925509)同源性最高.E2基因的同源性比对显示,与中国北京株BJ1308(Genbank:KT951841)同源性最高.对样本进行E2基因序列分析和理化性质分析可知,E2核苷酸水平上有58.9％的可变性位点(763/1296),保守区有两段:核苷酸位置394～541以及919～1234.有两个潜在的跨膜信号区域:30～50和410～420.蛋白不稳定性为33.62,可以将该蛋白质分类为稳定的蛋白质.E2基因的抗原表位与瑞士毒株SuwaCp(Genbank:KC853441)的抗原表位优势部分走势基本一致.分离获得的毒株为我国BVDV毒株资源与分子流行病学提供了资料.