犬Ⅰ型腺病毒E1A蛋白的生物信息学分析

为进一步了解犬Ⅰ型腺病毒,并深入探究E1A蛋白的基本结构,为CAdV-Ⅰ的研究奠定基础.该研究利用Protparam、ProtScale、SignalP 5.0 Server和TMHMM Server 2.0等在线服务器对E1A蛋白的理化性质、信号肽和二级及三级结构等进行预测.结果 发现,E1A蛋白氨基酸数量为225个;等电点为11.86,带正电荷氨基酸残基数和带负电荷氨基酸残基数分别为36和2;E1A蛋白为有跨膜结构、疏水性蛋白、无信号肽、无糖基化位点、含有9个丝氨酸磷酸化位点,10个苏氨酸磷酸化位点,不存在酪氨酸磷酸化位点;α-螺旋和无规则卷曲结构是E1A蛋白的二级结构中最主要的元件,可信度为19.0％,蛋白覆盖率为9％,有6个抗原决定簇.以上结果有利于进一步开展E1A蛋白的研究,为建立CAdV-Ⅰ的抗体检测方法和亚单位疫苗提供了基础.该研究运用生物信息学分析方法预测E1A蛋白,但生物信息学是在已有知识基础上的预测,所以未来还需要对此进行进一步研究探讨.