猪血清淀粉样蛋白3分子SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用

分别根据猪血清淀粉样蛋白3(serum amyloid A3,SAA3)基因序列以及猪三磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)基因全长序列设计特异性扩增引物,进行PCR扩增,并将PCR扩增片段连接至相应载体上构建重组质粒.两个重组质粒经测序鉴定和纯化后,倍比稀释作为标准曲线样品,用于实时荧光定量PCR中SAA3、GAPDH标准曲线的制备,并进行反应的灵敏性、特异性和重复性检测.结果显示,标准曲线线性关系R2均在0.98以上;特异性检测显示该引物可以特异性检测到猪SAA3、GAPDH扩增曲线;组内和组间变异系数均小于5%,说明本研究成功建立猪SAA3的荧光定量PCR检测方法.运用建立的荧光定量RT-PCR对正常以及感染猪繁殖与呼吸综合征病毒的肺泡巨噬细胞和猪组织进行检测,可检测到猪SAA3的表达,正常组与接毒组之间显示出明显的表达差异.本研究初步建立了检测猪SAA3基因的SYBR Green荧光定量RT-PCR的方法,为后续对猪传染性疾病与猪SAA3之间相互关系的研究提供了一种特异、灵敏的检测方法.