广西乌鸡线粒体DNA D-loop区序列遗传多样性分析

China Poultry(2015)

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摘要
采用PCR和直接测序的方法测定广西东兰乌鸡线粒体DNA (mtDNA) D-loop第一高变区序列,比较分析东兰乌鸡(片羽、丝羽)的遗传变异.结果表明:在东兰乌鸡mtDNA D-loop区中,共发现27个变异位点,46种单倍型,其变异方式主要是转换和缺失;检测片段的G+C含量(60.59%)明显高于A+T含量(39.41%),具有偏倚性(P<0.05);单倍型多样度和核苷酸多样度分别为(0.890±0.020)、(0.01653±0.02483),表明东兰乌鸡的遗传多样性较丰富,其中丝羽乌鸡的变异位点、单倍型数量、单倍型多样度和核苷酸多样度等均比片羽乌鸡高.在NJ系统发生树上,东兰乌鸡分为3大支,说明具有3个血统来源,起源于中国红色原鸡.
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