食管癌放射抗拒关键基因及通路的生物信息学分析

目的 寻找食管癌放射抗拒关键分子及通路,从分子水平揭示食管癌放射抗拒发生机制.方法 从基因芯片公共数据库GEO中下载食管癌放射抗拒相关芯片数据(GSE61772,GSE61620);进一步运用GEO2R进行差异基因分析,利用DAVID、String等分析软件对差异基因进行生物信息学分析.RT-PCR技术检测差异基因在不同放射敏感性细胞中表达差异.结果 两组芯片数据中共筛选出49个差异基因,这些基因参与生物学过程主要集中在调节多细胞生物合成、离子转运、DNA合成、代谢、调节细胞增殖等.差异基因涉及的主要生物学通路是Wnt信号通路.12个差异基因间存在相互作用关系,关键节点为CHN2.CHN2基因在不同放射敏感性食管癌细胞中表达未见明显差异.结论 包括CHN2在内的49个差异基因可能与食管癌放射抗拒发生相关,Wnt信号通路在其中具有重要作用.