2017年济南市柯萨奇病毒A16型VP1基因特征分析

目的 对济南市2017年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原中的柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)分离鉴定,分析VP1基因遗传进化特征.方法 整理分析2017年济南市HFMD监测样本,采用简单随机抽样方法选取CV-A16核酸阳性样本经预处理后接种人横纹肌肉瘤(human rhabdomyosarcoma,RD)细胞,对产生明显细胞病变效应的毒株进行鉴定,测定VP1基因序列,应用MEGA5.2软件构建系统进化树,通过Lasergene软件对VP1进行核苷酸及氨基酸同源性分析.结果 通过细胞分离获得10株CV-A16阳性病毒株,均属B1b亚型,分别位于3个不同簇,核苷酸及氨基酸序列同源性分别为94.9％ ～ 100％和99.3％～100％,与我国CV-A16上海株(KX871333)(同源性99.7％)、河南株(KM260134)(99.0％)、江苏株(KP751580、KR138327)(98.7％)及广东株(MH004016) (98.5％)亲缘关系较近.与国内参考株相比,济南市CV-A16分离株VP1存在N14S、S59R、E145V变异.结论 CV-A16病毒株B1b基因亚型为济南市优势毒株,VP1蛋白发生氨基酸变异.