青海地区急性呼吸道感染症候群中人冠状病毒及鼻病毒分子流行病学研究

目的 了解青海地区急性呼吸道感染人群中人冠状病毒(human coronavirus,HCoV)及鼻病毒(human rhinovirus,HRV)的分布,探讨其分子流行病学特征.方法 采集2010年5月至2015年5月青海地区急性呼吸道症候群病例鼻咽拭子445例,采用荧光定量反转录聚合酶链式反应(quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction,qRT-PCR)方法对HCoV 6种亚型(OC43,HKU1,229E,NL63,SARS和MERS)及HRV进行检测,并分析其分子流行病学特点.结果 445例样本中共检出HCoV 34例,检出率7.64％,其中HCoV-OC43 19例(4.26％)、HCoV-HKU1 15例(3.37％),其他亚型未检出.HRV检出16例,检出率3.59％.HCoV-OC43在20-60岁年龄组检出率最高,为9.48％,且不同年龄组差异有统计学意义(Fisher's确切概率P =0.0011).HRV在门急诊病例中的检出率比住院病例高,为6.72％,且差异有统计学意义(Fisher's确切概率P =0.0432).HCoV-OC43与HCoV-HKU1夏季检出率最高,分别为为7.20％ (9/125)、9.60％(12/125);不同季节HCoV检出率差异有统计学意义(x2=25.08,P＜0.0001).HRV春季检出率最高,为10.17％ (6/59),不同季节检出率差异有统计学意义(Fisher's确切概率P=0.0449).HCoV感染阳性样本Ct值中位数36.81(35.54-37.49),在住院病例中为36.93(35.54-37.53),在门急诊病例中为36.68(31.18-36.84),差异无统计学意义.HRV阳性样本Ct值中位数31.83 (27.16-33.65),在住院病例中为28.97(26.39-33.79),在门急诊病例中为32.34(30.85-33.65),差异无统计学意义.结论 HCoV及HRV流行高峰主要为夏季和春季,其中HCoV-OC43/HCoV-HKU1是HCoV感染的主要亚型.Ct值在一定程度上反映了HCoV和HRV在不同病例类型中病毒载量的差异.