中国部分地区柯萨奇病毒B组5型分子流行病学研究

目的 研究中国部分地区柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CV-B5)分离毒株基因特征和遗传进化规律.方法 利用MEGA6.0软件对GenBank核苷酸数据库收录的分离于中国11个省市CV-B5分离毒株全长VP1区基因序列进行分析,绘制系统进化树,测算分离毒株核苷酸和氨基酸同源性,并计算核苷酸分子进化速率.结果 纳入中国11个省市CV-B5分离毒株合计189株,主要为基因型C,占分离毒株总数的90.5％.与基因型A相比,中国11个省市CV-B5分离毒株VP1区核苷酸和氨基酸同源性为79.8％～82.8％和92.6％ ～ 97.9％,收录中国地区CV-B5分离毒株间核苷酸和氨基酸同源性为80.3％～ 100.0％和91.5％～ 100.0％.基因型C分离毒株核苷酸进化速率为4×10-3/(位点/年).结论 中国部分地区CV-B5分离毒株潜在优势流行株为基因型C,又以基因亚型C1和C2共循环流行.