诺如病毒重组株GⅡ.P16-GⅡ.2在广州地区引起暴发的分子流行病学调查

Chinese Journal of Clinical Hepatology(2019)

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摘要
目的 揭示2016年7月至2017年6月广州市诺如病毒暴发流行的源头及其规律.方法 通过哨点医院和各级疾控中心收集病例信息和粪便标本,用荧光定量PCR方法对标本中的诺如病毒核酸进行检测,并对阳性标本核酸进行扩增和测序,通过BLAST比对寻找同源性最接近的参考序列并构建系统发生树.结果 通过广州市感染性腹泻监测网络共收集标本854人份,患者男女性别比为1:0.67,78.33%的病例为7岁以下学龄前儿童,共检出诺如病毒GⅡ组核酸阳性220份(25.76%,合并GⅠ组核酸阳性5份);2016年下半年流行的主要型别是GⅡ.Pe-GⅡ.4.Sydney_2012型(94.64%),2017年上半年流行的主要型别是GⅡ.P 16-GⅡ.2型(67.65%).2016年9月份开始广州市诺如病毒感染性腹泻疫情的报告数逐渐增多,至2017年2~3月份迎来发病高峰,4月份疫情报告数开始下降,5~6月份之后腹泻疫情报告数下降至2~3起/月.2016年9~11月份的暴发疫情均由GⅡ.Pe-GⅡ.4.Sydney_2012型引起;2016年12月至2017年4月的暴发疫情由GⅡ.P16-GⅡ.2型引起;部分疫点的厨工和保育员标本中有检出诺如病毒GⅡ组阳性,且与病例标本的型别一致.结论 2016至2017年冬春季节在广州地区暴发的诺如病毒疫情是诺如病毒重组株GⅡ.P16-GⅡ.2型在本地的首次暴发,各疫点间病毒基因序列同源性较高,提示可能是同一来源;部分疫点的厨工和保育员可能在部分疫情的扩散中扮演了重要的角色.
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