Cytokine Array蛋白点表达丰度分析软件的优选研究

目的 比较3款常用图像分析软件对细胞因子矩阵(Cytokine Array)相同任意蛋白点表达的差异,优选出最适图像分析软件.方法 从本实验室获得的一对Cytokine Array图像,任选图上4个蛋白点,以3款图像分析软件(Gel-Pro analyzer/Labwork、Quantity One和Image J)反复分析其蛋白丰度,比较其复杂性和可重复性,并针对入选蛋白,行酶联免疫吸附试验(ELISA)对比验证其吻合程度.结果 3款分析软件分析过程的复杂程度由简到繁依次为Gel-Pro analyzer/Labwork、Quantity One和Image J;可重复性从大到小(即变异系数从小到大)依次为Gel-Pro analyzer/Labwork(0.00%)、Quantity One(5.07%)和Image J(9.75%);若以ELISA(81.49%)结果为标准参考值,则吻合度从高到低依次为Quantity One(71.61%)、Image J(67.27%)、Gel-Pro analyzer/Labwork(62.31%).结论 各种软件均具备独自特点,如果仅作定性分析,推荐Gel-Pro analyzer/Labwork;如果作半定量分析,推荐Quantity One.若综合可重复性、分析过程的复杂程度、与ELISA结果的吻合程度,则推荐Quantity One.