尿液标本淋球菌多抗原序列分型研究

Chinese Journal of Dermatology(2013)

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摘要
目的 探讨江苏常州、扬州,广西梧州、贺州,海南三亚、琼海,广东江门、茂名淋球菌多抗原序列分型(NG-MAST)的型别分布.方法 88份淋球菌核酸检测阳性的男性性病门诊就诊者(MSP)的尿液标本,用Qiagen试剂盒提取DNA,并进行2次PCR扩增porB、tbpB基因片段,扩增成功的标本测序后登陆NG-MAST网站进行序列比对,获取菌株基因型别信息.结果 对88份阳性标本提取DNA进行单次PCR,扩增porB、tbpB基因的效率分别为13.6%和14.8%,共有12份标本比对成功,得到菌株基因型别,分型效率为13.6%(12/88);进行2次PCR扩增后,porB、tbpB基因的PCR扩增效率分别为71.6%和72.7%,分别增长了58.0%和57.9%,共有62份标本比对成功得到菌株基因型别,分型效率为70.5%(62/88),分型效率提高了56.9%.62份标本共分出45个基因型,其中40个型为已知型别,5个为新型别.所有型别中,ST1866型丰度最高,有6份标本为此型别,ST1972、ST3356各有4份标本,都集中于江苏项目点.ST532有3份,集中于广东项目点.ST2221有2份,集中于广西项目点,其余各基因型均只有1份标本,散在分布于各省.5个新型别为:porB基因型为892、tbppB基因型98%相似于46型的标本,且丰度较高,仅发现于江苏项目点;porB基因型为903、tbpB基因型99%相似于958型;porB基因型为130、tbpB基因型96%相似于504型;porB基因型为2790、tbpB基因型99%相似于32型;porB基因型为1053、tbpB基因型99%相似于856型.结论 尿液标本可以用于NG-MAST分型研究,2次PCR扩增可以提高尿液标本的分型效率,不同地区淋球菌NG-MAST型别表现为多样性.
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