2017年深圳地区冬季诺如病毒基因分型与流行病学分析

目的 对深圳地区2017年冬季诺如病毒(Norovirus,NoV)流行株基因型、流行病学特点及同源性进行分析和研究.方法 通过提取313份粪便样品的核酸后利用NoV特异性引物进行逆转录PCR(RT-PCR),将阳性PCR产物测序.根据样品测序序列及NoV参考株序列,利用软件Mega 4.1及Clustal W构建系统发生树.结果 NoV阳性样品共26份且均为GⅡ.4型,分别与GⅡ.4(KY407156)、GⅡ.4(KY580757)及GⅡ.4(KX372682)具有较高的同源性.此外,88.46％ 的NoV样品与本地区历年流行株同源性较低,且46.15％ 与我国其他地区流行株存在差异.结论2017年冬季深圳地区诺如病毒流行株以GⅡ.4型为主,且其在流行性及同源性上具有自身的特点,在当地公共卫生工作中需加强关注.