HLA新等位基因B*51:159的序列分析及三维分子结构模拟

目的 确认1例汉族个体携带的人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)B位点的新等位基因,分析其核苷酸序列,并模拟其编码蛋白的三维分子结构.方法 应用DNA测序分型技术(sequencing-based typing,SBT)对1名中华骨髓库汉族捐献者的HLA-A、-B、-DRB1基因进行分型,对可疑结果采用单链测序基因分型技术直接测定基因序列,分析其与同源性最高的HLA等位基因序列的差异,最后用Swiss-Model对新等位基因进行三维分子结构模拟.结果 该个体HLA-B位点的一个等位基因为B* 44:03:01,另一个等位基因为B*51组的新等位基因.与同源性最高的HLA-B* 51:01:01:01相比,其第2外显子nt329位置的A突变为C,并导致相应的86位密码子由AAC变为ACC,所编码氨基酸由天冬酰胺(Asn)变为苏氨酸(Thr).结论 确认了1个HLA-B新等位基因,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B* 51:159,构建了其三维分子结构模型.