葛根SSR特征及江西粉葛DNA身份证的构建

Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica(2019)

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摘要
使用生物信息学方法分析野葛Pueraria lobata和甘葛藤P.thomsonii基因组SSR(simple sequence repeat)序列.分别获得66 191,71 968个SSR位点,据此开发了20对SSR引物,从中筛选出5对多态性较强、扩增带型稳定的引物,对江西产区9个不同粉葛栽培种进行遗传多样性分析,共得到16个多态信息位点,平均每个SSR引物多态信息含量(PIC)为0.600 7;对9个粉葛栽培种进行亲缘关系聚类,结果显示9个粉葛栽培种可归为6个种质.该研究利用5对核心引物组合,为江西粉葛种质建立了DNA身份证,为粉葛优良种质筛选和中药材道地性研究提供参考信息.
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关键词
DNA identity card,Pueraria lobata,Pueraria thomsonii,genomic SSR
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