基于甲基化的年龄推断模型构建与效能评估

Fa yi xue za zhi(2019)

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摘要
目的 筛选与中国北方汉族男性个体年龄相关的DNA甲基化位点并构建年龄推断模型.方法 筛选21个候选甲基化位点,使用EpiTYPER技术平台在476份汉族男性血液DNA中检测包含上述位点在内的21个扩增片段,共获得153个DNA甲基化位点数据.结果 通过相关性分析,最终筛选出8个与年龄高度相关的DNA甲基化位点,其中CpG1、CpG2、CpG4、CpG7和CpG8分别位于TRIM59、RASSF5、Clorf132、CSNK1D和ELOVL2上,CpG5、CpG6均位于PDE4C上,CpG3位于17号染色体21452808位置上.其中352份样本用于模型构建,基于这8个位点构建的多元线性回归年龄推断模型,R2=0.93,平均绝对偏差(mean abso?lute deviation,MAD)为2.69岁;109份样本用于模型验证,MAD为3.80岁.在15份新的样本中重复检测三次,MAD分别为4.08岁、4.68岁和3.93岁.结论 本研究构建的中国北方汉族男性个体年龄的推断模型,可用于公安实战中受害者和嫌疑人的年龄推断,缩小案件的侦查范围,具有实际应用价值.
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关键词
forensic genetics, forensic anthropology, DNA methylation, age determination, linear model, Han nationality, northern China, males
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