应用创造酶切位点PCR-RFLP检测POT1基因rs1034794位点多态性

Chinese Journal of Industrial Medicine(2015)

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摘要
目的 建立人端粒保护蛋白1 (protection of telomeres 1,POTl) rs1034794位点多态性的检测方法.方法 应用创造酶切位点法(created restriction site PCR,CRS-PCR)根据单碱基突变位点的碱基替代情况设计PCR引物.其中1条引物根据突变位点邻近序列设计,引入错配碱基,使得引物3'端和单碱基突变的一种突变型在PCR扩增后形成1个酶切位点,PCR产物用PCR-限制性片段长度多态性(PCR restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)法进行分析.结果 设计1对特异引物,其中正向引物3'末端与多态相邻,倒数第三位碱基为错配碱基A可在PCR扩增后与多态T等位基因及相邻片段形成AGCT结构,使用限制性内切酶AluI酶切效果较好.结论 应用CRS-PCR方法创造的酶切位点可以有效而简捷地检测POT1 (rs1034794)基因多态性.
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关键词
created restriction site,single nucleotide polymorphism,telomeres protection protein 1 (POT1),primer design
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