猪博卡病毒全基因组序列分析与基因分型研究

Shao-min QIN,Jian-min WU,Lin MA,Long Yuan,Feng-lian CHEN,Ling MA,An-bin BAI

Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine（2014）

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摘要

为了解猪博卡病毒(PBoV)的基因组结构和遗传进化规律,并研究可行的PBoV基因分型方法,本研究利用GenBank中登录的28条PBoV全基因组序列信息,采用DNAStar生物信息学软件进行基因组序列分析.结果显示,分别选取全基因组、NS1基因、NP1基因和VP1基因构建的系统进化树,其基因分型结果基本一致,PBoV均被划分为3个基因群,基因群内各病毒株的核苷酸序列同源性较高,并且具有独特的序列特征和规律,而各基因群之间病毒株的核苷酸序列同源性非常低,基因组结构差异较大,充分证明了PBoV基因分型的可行性.

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