2006-2014年中国八省份肠致病性大肠杆菌分离株的多位点序列分型分析

目的：了解2006—2014年分离自我国8个省份不同宿主的肠致病性大肠杆菌（EPEC）的分子分型特征。方法于2006—2014年，从我国8个省份的腹泻病例、动物粪便、食品中分离大肠杆菌菌株，根据分离年代、地点、宿主来源以及PFGE带型特点，选取其中的149株EPEC分离株。选择大肠杆菌多位点序列分型（MLST）数据库提供的7个管家基因，采用SeqMan II、MEGA 5.05、eBURST V3等软件，对已有的国内外392株菌（大肠肝菌MLST数据库中包含的菌株为243株，本次研究采集的菌株为149株）的173个ST型进行聚类分析。结果56种ST型别中，ST-40型菌株比例较高，占12.8%（19/149），为优势型别菌株；新ST型别有19种，7个管家基因中有6个（adk、fumC、gyrB、icd、mdh和purA）检测到11种新等位基因型。同时包括腹泻病例和动物粪便来源的菌株的ST型别为6种，其EPEC类型均为非典型EPEC（aEPEC）；同时包括腹泻病例和食品来源的菌株的ST型别为2种，其EPEC类型均为非典型EPEC（aEPEC）。eBURST聚类分析显示，173种ST型别中，33种ST型别形成了5个主要ST序列群，分别为STC-29、STC-10、STC-20、STC-28和STC-517，其余140种ST型别菌株散在分布于其他克隆群中或为单例。结论我国8个省份的EPEC分离株的ST型别呈高度多样性，与腹泻患者分离株存在相同ST型的动物粪便和食品分离株的EPEC类型均为aEPEC。