2015年黔东南地区麻疹病毒分离株基因特征分析

Modern Preventive Medicine(2018)

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摘要
目的 分析2015年黔东南地区麻疹病毒基因型别和特征.方法 采集疑似麻疹病例临床咽拭子标本,经Realtime RT-PCR初筛为麻疹病毒核酸阳性,使用Vero/SLAM细胞进行病毒分离,对阳性分离物提取病毒RNA,采用RTPCR方法扩增麻疹病毒N基因羧基末端编码的634个核苷酸片段,并进行测序与分析.结果 35例疑似麻疹病例中检测到4例麻疹病毒阳性核酸,经分离得到2株麻疹病毒.基因亲缘关系显示2株为H1基因型中的H1a基因亚型.2株麻疹病毒株与H1基因型参考株MVi/Hunan.CHN/0.93/7 (AF045212)比较,核苷酸和氨基酸同源性分别为97.7%和98.0%;与H1a基因亚型参考株Chin9322比较,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.9%和99.3%;2株H1a基因亚型与往年及本省流行的麻疹病毒的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.2%~100%和98.0%~ 100%.结论 黔东南地区2015年分离到的麻疹病毒为H1a基因亚型,与贵州省本土麻疹流行的优势基因亚型一致.
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