Estudio genómico de la región crítica del cromosoma 21 asociada con el síndrome de Down

Introduccion: Analisis previos han identificado una region del cromosoma 21, conocida como region critica del sindrome de Down (DSCR) en donde se localizan algunos genes cuya expresion modularia las principales caracteristicas clinicas de este sindrome. En este sentido, existe poca informacion detallada sobre la arquitectura de la cromatina asociada con la DSCR. Objetivo: Obtener in silico, a partir de la evaluacion de covariables genomicas contenidas en bases de datos publicas, una vision detallada de la estructura cromatina asociada con la DSCR. Metodos: Tomando como referencia la informacion consignada en el National Center for Biotechnology Information, el Genome Browser de la Universidad de California en Santa Clara y el proyecto internacional HapMap, se efectuo un paseo cromosomico a lo largo de 21Mb de la porcion distal del brazo q del cromosoma 21, para registrar el numero de polimorfismos de nucleotido unico, el de islas CpG, de secuencias repetidas, las tasas de recombinacion y el estado topologico de la cromatina asociada. Resultados: La frecuencia de islas CpG y de genes referenciados se incremento en los ultimos 1,2 Mb de la region distal en contraste con su distribucion pericentromerica. La mayor tasa de recombinacion calculada en este estudio para mujeres se registro en las bandas 21q22.13 y 21q22.3. Los genes DSCR 6 y 9 presentaron un elevado grado de metilacion en islas CpG tanto en fibroblastos normales como en trisomicos. En el gen DSCR2 se observo un alto grado de descondensacion cromatinica, ademas de metilacion de diferentes residuos de lisina de la histona H3. Conclusiones: La existencia de un ambiente genomico caracterizado por tener elevadas tasas de recombinacion y de metilacion de genes DSCR 6 y 9, permite postular que en la no disyuncion asociada con el SD, operarian complejas interacciones genomicas, epigeneticas y ambientales que actuarian en algunos procesos meioticos.