构建mRNA/miRNA/蛋白质调控网络寻找胰腺导管腺癌分子标志物

目的：整合高通量miRNA/mRNA/蛋白质表达数据，寻找胰腺导管腺癌（pancreatic ductal ade-nocarcinoma, PDAC）分子标志物（Biomarker）。方法本文提出利用PDAC样本的mRNA、miRNA与蛋白质表达谱数据，通过“转录因子（TF）调控miRNA”与“miRNA靶向调控基因”的关系构建在PDAC发病过程中的核心调控网络，并据此预测定义选候PDAC相关mRNA与miRNA，同时利用差异表达蛋白进一步定义调控网络。结果发现6个miR let-7家族miRNA成员（hsa-let-7i、hsa-let-7d、hsa-let-7b、hsa-let-7g、hsa-let-7c、hsa-let-7e）与5个在基因与蛋白层面同时差异表达的基因（ALDH1A1、TGFB1、ANX-A2、FN1、THBS1）形成的一个核心调控网络，其网络中涉及的5个基因全都为已知与PDAC发生发展明确相关的分子。利用5个基因对3套大规模的PDAC表达数据进行分型分析，结果发现其分类准确性分别达到了93%（91%～94%）、90%（89%～92%）与88%（87%～89%）。结论通过miRNA/mRNA/蛋白三种数据整合分析得到的5候选标记基因具有良好的分型能力，可作为新的PDAC分型Biomarker。