玉米苗期SR蛋白基因家族的干旱胁迫应答

Yi chuan = Hereditas / Zhongguo yi chuan xue hui bian ji(2014)

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摘要
基因表达的选择性剪接(Alternative splicing,AS)调控与植物对逆境胁迫应答密切相关,SR蛋白(Serine/arginine-rich proteins)是其中关键的调节因子.文章对玉米B73参考基因组进行分析显示:多数SR蛋白家族基因成员启动子区域含有3~8种与发育或胁迫相关的顺式调控元件;27个基因成员编码碱性蛋白,其中23个成员的编码蛋白依照其N '端的首个RRM(RNA recognition motif)结构域特征大体上可划分为5个亚组.利用双向分级聚类方法,对三叶期干旱胁迫下玉米杂交种郑单958及其亲本郑58和昌7-2的SR蛋白基因家族的分析显示,该基因家族的表达模式具有明显的组织表达特异性和基因型依赖性特征;其中在干旱胁迫下地下组织以下调表达模式为主,而地上组织中以上调表达模式为主.在重度干旱胁迫后的3个不同时段复水过程中,地上和地下组织中SR蛋白基因家族的表达皆以下调表达模式为主.另外,尽管不同基因成员的表达模式在干旱胁迫及其后的复水过程中存在明显差异,但普遍存在自身选择性剪接现象.SR蛋白基因家族在玉米干旱胁迫的应答规律,为从AS-network视角解析玉米的抗逆分子机制提供了新思路.
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