TET2 LMTK2和FAM84B基因与前列腺癌的关系

Zhonghua zhong liu za zhi [Chinese journal of oncology](2013)

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摘要
目的 探索TET2基因(rs7679673,A)、LMTK2基因(rs6465657,T)和FAM84B基因(rs12543663,C)的常见变异类型与前列腺癌患病风险的关系,分析前列腺癌患者的基因型与临床特征和生活习惯的关系.方法 采用病例对照研究设计,比较病例组和对照组TET2基因(rs7679673,A)、LMTK2基因(rs6465657,T)和FAM84B基因(rs12543663,C)的等位基因和基因型频率的差异,采用x2检验分析各基因型与患者的确诊年龄、体质指数、Gleason评分、血清前列腺特异性抗原浓度、肿瘤分期等的关系,采用多因子降维(MDR)方法分析基因-基因交互作用.结果 FAM84B基因(rs12543663,C)的CC+ CA基因型在病例组和对照组中的频率分布差异有统计学意义(P=0.046).TET2基因(rs7679673,A)和LMTK2基因(rs6465657,T)的AA、AC和CC基因型和等位基因在病例组和对照组中的频率分布差异均无统计学意义(均P>0.05).FAM84B基因(rs12543663,C)的CC+AC基因型在不同肿瘤分期前列腺癌患者中的分布频率,差异有统计学意义(P =0.002).TET2基因的AA、AC和CC基因型在不同吸烟和饮酒情况的前列腺癌患者中的分布频率,差异均有统计学意义(均P<0.05).LMTK2(rs6465657,T)基因的TT+TC和CC基因型在是否接受手术治疗的前列腺癌患者中的分布频率,差异有统计学意义(P =0.003).树状图分析结果显示,TET2(rs7679673,A)和LMTK2(rs6465657,T)基因位点之间距离更近,存在更强的基因-基因交互作用.MDR方法验证最佳模型的检验平衡精度为0.5120,交叉验证一致性为100%(P=0.0270).结论 FAM84B基因可能与中国人前列腺癌患病风险和肿瘤分期有关,TET2、LMTK2和FAM84B基因的协同作用可能与前列腺癌的患病风险有关.
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