人巨细胞病毒Merlin株全基因组的重叠基因结构与功能分析

目的 分析人巨细胞病毒(HCMV)merlin株全基因组存在ORF重叠的基因,揭示HCMV重叠基因的结构与功能特征.方法 应用生物信息学方法 搜索HCMV Merlin全基因组中的ORF重叠基因,分析HCMV merlin株重叠基因的编码序列CDS和ORF起止位点,计算CDS和ORF的长度,编码蛋白的相对分子质量,重叠长度,蛋白编码方向,确定重叠序列,重叠类型,分析重叠基因的表达时相和编码蛋白的功能.结果 HCMV merlin株存在39个重叠ORF的基因,占全基因总数的23%,39个ORF重叠基因之中有13个IE基因,9个E基因,17个L基因,可分为16个重叠群,2个基因重叠的有11个重叠群,3个基因相互重叠的有3个重叠群,4个基因相互重叠的有2个重叠群,重叠基因功能广泛.结论 HCMV Merlin株中存在大量的复杂的重叠基因,为进一步研究重叠基因的转录和翻译调控机制奠定了基础.