13个VNTR位点用于113株结核分支杆菌的基因分型研究
Zhonghua liu xing bing xue za zhi = Zhonghua liuxingbingxue zazhi（2006）
摘要
目的 应用数目可变串联重复序列(VNTR)分子分型技术,对北京地区113株肺结核临床分离菌株进行分型研究,探讨北京地区菌株DNA多态性和基因型特征.方法 采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术对结核分支杆菌13个VNTR位点进行检测,并应用Gel-Pro analyzer 3.1软件和BioNumerics 3.0软件进行结果分析.结果 113株结核分支杆菌可分为4个基因型(分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ和V型),其中Ⅰ型占92.0%(104/113),其他3型所占比例很小,分别为Ⅱ型占4.4%(5/113),Ⅳ和V型均为1.8%(2/113),而标准菌株H37Rv在分型中为独立的一个基因型,即Ⅲ型.结论 北京地区的结核分支杆菌存在基因多态性,其主要流行型为Ⅰ型.
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关键词
Variable number of tandem repeats,Genotyping,Cluster analysis,Mycobacterium tuberculosis
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