7个VNTRs用于65株中国分离的结核分枝杆菌基因多态性研究

Chinese Journal of Microbiology and Immunology(2004)

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摘要
目的应用数目可变串联重复位点(variable number of tandem repeats, VNTRs)分子分型技术,初步探讨我国结核分枝杆菌的基因多态性特征. 方法采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术,对结核分枝杆菌的11个数目可变重复位点进行检测,并应用Gel-Pro analyzer 3.1软件和BioNumerics(Version 3.0)软件进行结果分析,分析结核分枝杆菌DNA多态性特征. 结果选取结核分枝杆菌基因组中的7个(ETR-A、ETR-B、ETR-C、ETR-D、ETR-E、ETR-F、 MPTR-A)具有明显多态性特征的串联重复位点,检测分析了65株来自安徽、湖南和江苏省的结核分枝杆菌,结果显示被测菌株可分为10个不同的基因型,其中以2个型别为主,占总菌株数的69.2%,其他菌株呈散在分布. 结论采用VNTR分型技术初步分析表明,中国结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,且存在主要流行菌群.
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关键词
Cluster analysis,Mycobacterium tuberculosis,Tuberculosis,VNTR-method
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