SARS冠状病毒全基因组序列初步分析

陈蕴佳,高歌,鲍一明,Rodrigo LOPEZ,吴健民,蔡涛,叶志强,顾孝诚,罗静初

Yi chuan xue bao = Acta genetica Sinica（2003）

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摘要

对已经完成全序列测定的12个SARS病毒基因组进行了多序列比对,发现序列主体部分29708 b具有99.82%的相同碱基,除2个序列各有5个和6个碱基的缺失外,其余部分共有42个位点核苷酸碱基的差异,其中28个位点的碱基差异可引起氨基酸残基改变.利用蛋白质二级结构和跨膜螺旋预测以及蛋白质定位等生物信息学工具,分析了这些产生氨基酸改变部位的蛋白质构像,推测了可能产生的结构和功能改变,为进一步生物学实验提供参考.所有分析结果同时在北京大学生物信息中心抗SARS网站(antisars.cbi.pku.edu.cn)上发布.

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关键词

SARS冠状病毒,多序列比对,蛋白质序列分析,生物信息学

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