长非编码RNA生物特征研究与分析

Chinese Science Bulletin(2013)

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摘要
长非编码RNA因其独特的生物特征和复杂的生物功能引起国内外广泛关注.本文对长非编码RNA的生物特征进行研究和分析,涉及长非编码RNA的鉴定、数据特征和功能特异性.首先从生物技术及计算预测两个层面对长非编码RNA的鉴定方法进行详细阐述,并列出当前主要的长非编码RNA数据库.其次,分析长非编码RNA的生物特征:核酸序列开放阅读框的长度、密码子偏好性、密码子替换频率、序列保守性等,以及长非编码RNA二级结构中长茎发夹结构的特异性出现,并论述了长非编码RNA的功能特异性,包括表达的时空特异性,复杂的代谢调控机制,与复杂疾病的关系.最后指出并探讨长非编码RNA未来需进一步研究的问题和主要研究方向.
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关键词
codon usage bias,Open Reading Frame(ORF),function prediction,secondary structure,codon substitution rate,long non-coding RNA(lncRNA)
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