新疆出血热病毒的实时荧光RT-PCR检测方法研究

苏锦坤, 师永霞,郑夔, 李小波,黄吉城, 相大鹏,幸芦琴,郭波旋

wf(2012)

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摘要
目的:建立新疆出血热病毒的实时荧光RT-PCR检测方法.方法:分析新疆出血热病毒核酸S片段序列的保守性,设计新疆出血热病毒实时荧光RT-PCR引物和探针.以体外转录后的RNA作为阳性对照模板,摸索出实时荧光RT-PCR检测的最佳引物浓度、探针浓度和反应体系条件,并进行灵敏度和特异性分析.结果:建立的新疆出血热病毒的实时荧光RT-PCR检测方法最佳反应体系为:正向引物CCHFV FP终浓度250 nM,反向引物CCHFV-RP终浓度500 nM,探针CCHFV-Probe终浓度500 nM;扩增程序为:50℃ 10 min,95℃ 10 min;95℃5 s,57℃20 s45次循环.该方法最低检测限约为2copies病毒/反应,与森林脑炎病毒和汉坦病毒无交叉反应.结论:该方法灵敏度高、特异性强,适用于新疆出血热病毒的快速检测.
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