LRP16基因启动子顺式调控元件分析

China Journal of Bioinformatics(2009)

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摘要
为分析LRP16基因启动子区顺式调控元件,为深入研究LRP16基因的表达调控机制奠定基础.首先在NCBI的人类基因组数据库中截取并下载LRP16基因转录起始位点5'侧翼区2.6kb的基因组序列,设计PCR引物,从健康外周血单个核细胞中扩增LRP16基因的启动子分子;然后构建包含长度为2.6kb的LRP16基因启动子分子的pGL3-LRP16启动子荧光素酶报道重组子,转染入Hela细胞后检测荧光素酶活性;最后利用Genomatix MatInspector Release professional 5.3、RSA-tools和TESS 3个启动子顺式调控元件数据库对LRP16基因启动子进行分析.结果表明LRP16基因启动子DNA序列具有真核启动子活性,该区域既有通用启动子结构,又具有与肿瘤发生、细胞周期调控和急性反应期蛋白有关的顺式调控元件,包括:Sp1、T-Ag、ZF5、CAC盒、PU.1、c-Ets、XPF-1、IL-6受体、雌激素受体和视黄醇受体.
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关键词
promoter,ER,IL-6 RE,LRP16 gene,RAR
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