极大节旋藻(Arthrospira maxima)生物钟基因kaiC的克隆及分析

Chinese High Technology Letters(2008)

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摘要
以 kaiC 基因簇部分已知序列为引物设计位点,采用 PCR 反应池法从节旋藻基因组 fosmid 文库中筛选到 kaiC 基因克隆,通过步移测序获得了 kaiC 基因全长序列。kaiC基因编码区长1554 bp,基因 GC 碱基含量平均为41.76%,密码子第三位明显偏向于 U。在基因上游385 bp 范围内发现一个可能的启动子序列和一些基因调控元件。KaiC 蛋白分析发现了 Walker A、DXXG、不完整的 Walker B 等重要模体和具有催化作用的功能位点。Southern 杂交的结果证明 kaiC 基因在极大节旋藻中为单拷贝。极大节旋藻 kaiC 基因的特殊结构特征为研究 kai 基因簇的进化提供了重要的启示。
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关键词
kaiC gene,molecular evolution,Arthrospira maxima,circadian clock gene
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