猪源性乙型脑炎病毒分离株全基因序列测定和分析

目的了解猪源性乙型脑炎病毒(乙脑病毒)的基因特征。方法对猪源性乙脑病毒株(JX61)进行全基因组序列测定和基因进化特性的分析。结果猪源性乙脑病毒JX61株全基因组全长均为10 964个核苷酸,含有一个开放阅读框架,编码3 432个氨基酸。与GenBank中选择的41株乙脑病毒全基因序列比较发现,其核苷酸同源为83.6%～99.3%,氨基酸总体同源性为94.9%～99.6%。通过全基因序列进行系统进化分析均显示该毒株属于基因Ⅰ型乙脑病毒。结论猪源性乙脑病毒JX61株属于基因I型,与国内分离株XJP613关系最为接近。提示猪体内的乙脑病毒基因型别有了新的变化,这也是浙江省在猪体第一次分离基因Ⅰ型乙脑病毒。