鼻咽癌细胞株6-10B质膜的分离及其蛋白质表达谱分析

Biotechnology Bulletin(2013)

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摘要
建立鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma,NPC)细胞株6-10B的质膜蛋白质表达谱,为鼻咽癌癌变机制研究提供有益数据资料。运用差速离心联合双水相的方法纯化NPC细胞6-10B质膜,Western blot印迹和电镜检测验证质膜纯度,一维凝胶电泳分离质膜蛋白质,液相色谱/串联质谱结合生物信息学鉴定质膜蛋白质,肿瘤差异蛋白质组数据库(dbDEPD)搜索质膜蛋白质与其他肿瘤的相关性。共鉴定到406种非冗余蛋白质,质膜蛋白质和质膜相关蛋白共255个(占62.8%),dbDEPD搜索显示145种质膜蛋白质中的46个与其他肿瘤相关,其中18个质膜蛋白质与其他肿瘤转移相关,进一步分析发现质膜蛋白质CD225、CD104和p63与同属头颈部肿瘤的口腔癌转移相关,提示它们也可能是NPC潜在的转移相关蛋白。本研究建立了NPC细胞株6-10B的质膜蛋白质表达谱数据库,为NPC癌变分子机制研究提供有价值的数据和信息。
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关键词
Nasopharyngeal carcinoma 6-10B cell Plasma membrane Proteomics Aqueous two-phase partition Mass spectrometry
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