基因识别问题及其算法实现
Mathematics in Practice and Theory（2013）
摘要
从大量的DNA序列中获取丰富的生物信息具有重要的理论意义和应用价值.计算得到了Z-curve与Voss两种映射下功率谱与信噪比的理论关系,而且通过核苷酸频数分布快速计算实数映射时的信噪比;提出了4种阈值确定方法和三个评价准则对不同的物种基因阈值进行了分析,累积概率分布交叉阈值法较其他方法最优;分析了固定长度窗口滑动法由于存在“毛刺”问题而造成预测精度下降,在此基础上提出了变步长阶梯平滑滑动法,与固定长度窗口滑动法相比较预测准确率提高了12.16％达到83％,同时还预测了6个未知序列的编码区域.
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关键词
classification threshold,3-cyclical,signal-to-noise ratio,power spectrum,gene prediction
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