锌胁迫下小麦SSH文库的构建及初步分析

Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology(2013)

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摘要
Zn是植物必需的微量元素,同时也是近年来造成环境污染的重金属元素之一.为了从基因表达水平揭示小麦Zn胁迫响应的分子机制,本研究利用抑制差减杂交(suppression subtractivehybridization,SSH)技术构建了Zn胁迫(0.5 mmol/L,1 mmol/L)下小麦的正反向SSH文库.从正反向文库中随机挑选阳性单克隆,并利用通用引物T7/Sp6对其进行验证.结果显示,正反库中分别获得307和821个EST序列,其片段长度在200~1 000 bp之间,它们反映了Zn胁迫下特异响应的基因.利用BLASTn和BLASTx将这些EST序列进行比对分析,在正、反库中分别筛选出221和641个uniESTs,其中751个uniESTs被注释(包括正库中193个和反库中558个).这些序列的功能主要涉及信号转导、抗氧化防御、转录与翻译、物质运输、核糖体结构、能量代谢,以及一些功能未知的基因.
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关键词
wheat,Zn stress,gene expression,suppression subtractive hybridization(SSH)
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