程源教授主要研究领域：信息技术管理、服务创新、数字经济、技术经济学，创业战略与制度环境等。在国内外重要期刊和顶级国际学术会议发表有关创新创业领域的论文60余篇，出版著作多部，论文主要发表在《信息系统研究》（Information Systems Research）、《生产与运作管理》（Production and Operations Management）等管理学顶级学术期刊及《中国软科学》、《科学学研究》、《科研管理》、《科学学与科学技术管理》、《数量经济与技术经济研究》、《投资研究》、《人民日报》等国内重要刊物。出版专著：《技术创新：战略与管理》、《技术经济学的基础理论与方法》、《全球创业观察中国报告（2007）：创业转型和就业效应》、、《2006，全球创业观察中国报告：基于2005年数据的分析》等。

程源教授曾经获得清华大学青年教师教学优秀奖（2009）、清华大学经管学院优秀教学一等奖多次、清华大学经管学院优秀教学二等奖多次，北京市哲学社会科学优秀成果一等奖（2000，2008）、清华大学优秀教学成果一等奖（2012）、教育部高等学校科学研究优秀成果三等奖（2012）、Emerald最佳论文奖（2015）。

程源教授作为项目负责人，主持国家自然科学基金、教育部、国家市场监督管理总局等部门的项目。项目成果具有广泛的社会影响。