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Generating single-cell gene expression profiles for high-resolution spatial transcriptomics based on cell boundary images
Bohan Zhang,Mei Li,Qiang Kang, Zhonghan Deng, Hua Qin, Kui Su, Xiuwen Feng,Lichuan Chen, Huanlin Liu,Shuangsang Fang,Yong Zhang,Yuxiang Li,
GigaByte (Hong Kong, China) (2024): gigabyte110-gigabyte110
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BatchEval Pipeline: batch effect evaluation workflow for multiple datasets joint analysis
Chao Zhang,Qiang Kang,Mei Li, Hongqing Xie,Shuangsang Fang,Xun Xu
GigaByte (Hong Kong, China) (2024): gigabyte108-gigabyte108
引用0浏览0WOS引用
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EAGS: efficient and adaptive Gaussian smoothing applied to high-resolved spatial transcriptomics
Tongxuan Lv, Ying Zhang, Mei Li,Qiang Kang,Shuangsang Fang,Yong Zhang, Susanne Brix,Xun Xu
GigaScienceno. 1 (2024)
引用0浏览0WOS引用
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Stereopy: modeling comparative and spatiotemporal cellular heterogeneity via multi-sample spatial transcriptomics
Shuangsang Fang,Mengyang Xu, Lei Cao, Xiaobin Liu, Marija Bezulj, Liwei Tan,Zhiyuan Yuan, Yao Li, Tianyi Xia, Longyu Guo, Vladimir Kovacevic, Junhao Xu,
biorxiv（2023）
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StereoCell enables highly accurate single-cell segmentation for spatial transcriptomics
Mei Li, Huanlin Liu,Shuangsang Fang,Qiang Kang,Jiajun Zhang,Fei Teng,Dan Wang, Weixuan Cen, Zepeng Li, Ning Feng,Jing Guo,Qiqi He,
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) (2023)
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