荣获国家技术发明二等奖1 项（第一完成人），省部级科技奖励14项。授权美国专利2项，国家发明专利100余项。1999年获国家杰出青年科学基金；并被评为农业部中青年有突出贡献专家；2000获国务院政府特殊津贴；2000年被遴选为中国农业科学院一级岗位杰出人才；2004年入选国家新世纪百千万人才工程；2012年被评为全国农业科研杰出人才；2013年被评为全国农业先进个人；2014年获中央机关“五一”劳动奖章。作为首席科学家带领“猪基因工程与种质创新团队”2008年入选中国农业科学院优秀创新团队，2012年入选农业部创新团队，2013年获中国农业科学院2008-2013年度先进集体，2015 年获中华农业科技奖创新团队奖。以通讯作者（含共同）在National Science Review、Elife、Protein Cell、Genome Biology、Redox Biology等刊物发表SCI论文200余篇，授权专利100件，软件著作权19件，制订国家标准9项。