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Kingdom-Wide CRISPR Guide Design with ALLEGRO
Amirsadra Mohseni, Reyhane Ghorbani Nia, Aida Tafrishi,Xin-Zhan Liu,Jason E. Stajich,Ian Wheeldon,Stefano Lonardi
biorxiv（2025）
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Advances in CRISPR-enabled Genome-Wide Screens in Yeast
Nicholas R Robertson, Sangcheon Lee, Aida Tafrishi,Ian Wheeldon
FEMS yeast research (2025)
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Computational Design of Dynamic Biosensors for Emerging Synthetic Opioids
Alison C Leonard, Chase Lenert-Mondou, Rachel Chayer, Samuel Swift, Zachary T Baumer, Ryan Delaney, Anika J Friedman, Nicholas R Robertson, Norman Seder, Jordan Wells, Lindsey M Whitmore, Sean R Cutler, Michael R Shirts,Ian Wheeldon, Timothy A Whitehead
bioRxiv the preprint server for biology (2025)
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Balanced Training Sets Improve Deep Learning-Based Prediction of CRISPR Sgrna Activity
Varun Trivedi, Amirsadra Mohseni,Stefano Lonardi,Ian Wheeldon
ACS SYNTHETIC BIOLOGYno. 11 (2024): 3774-3781
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