黄晓军，1964年8月生，江西省南丰县人，血液病专家，中国医学科学院学部委员 ，中国工程院院士，北京大学血液病研究所所长，北京大学人民医院血液科主任医师、教授。
黄晓军主要从事造血干细胞移植与细胞治疗、血液恶性肿瘤等临床方向研究。
黄晓军长期致力于解决血液恶性肿瘤的发病机制和治疗的关键科学问题。带领团队创建全球首个非体外去T细胞单倍型相合（半相合）造血干细胞移植体系——“北京方案”(Beijing Protocol)，解决了供者来源匮乏这一世界性医学难题。2000年起，基于发现粒细胞集落刺激因子在人体内抑制细胞排异功能的机制]，黄晓军团队完成首例非体外去T单倍型造血干细胞移植手术并获成功，2016年，黄晓军团队创建的治疗方案被世界骨髓移植协会正式命名为“北京方案”。