主要从事番茄育种和抗逆生理方面研究，先后主持国家科技支撑、“863”计划、行业科技项目、国家自然基金等科研项目，是“十三五”国家重点研发计划“七大作物育种”重点专项总体专家组专家，农业部蔬菜专家指导组组长。享受政府特殊津贴，农业部有突出贡献中青年专家。在番茄耐低温弱光生理机制和鉴定技术，以及抗病虫分子遗传机制方面取得一系列研究成果。组织发起了世界上首个利用新一代测序技术进行的作物基因组测序计划，共同主持完成了番茄基因组重测序和变异组学分析，为推动我国园艺作物基因组学研究走向世界前列发挥了重要作用。选育出了10多个优良鲜食番茄新品种大面积推广，在《Nature genetics》等学术杂志上发表论文100余篇。