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我们实验室主要是利用基于DIA(Data-independent Acquisition, 数据不依赖型采集)定量质谱来研究细胞内信号通路。细胞中的信号传导大部分是由蛋白质复合物组装和解离来完成的。我们实验室利用定量质谱来研究细胞内源复合物的组装和解离,以期更深刻地理解信号细胞内信号传导过程。
我们首先利用亲和纯化(Affinity Purification)的方法纯化蛋白质复合物,然后利用DIA质谱技术鉴定和定量蛋白质复合物中的蛋白成分。我们称之为AP-DIA-MS方法。此套方法不仅可以鉴定参与信号通路中的未知蛋白,也可以研究蛋白复合物中已知蛋白成分的相对比例。此外,这个方法还可以研究复合物中翻译后修饰的动态变化,比如蛋白磷酸化在信号通路中作用。我们已经利用这套方法研究了TNF和LPS信号通路。未来我们会利用这个方法研究更多的信号通路。
我们首先利用亲和纯化(Affinity Purification)的方法纯化蛋白质复合物,然后利用DIA质谱技术鉴定和定量蛋白质复合物中的蛋白成分。我们称之为AP-DIA-MS方法。此套方法不仅可以鉴定参与信号通路中的未知蛋白,也可以研究蛋白复合物中已知蛋白成分的相对比例。此外,这个方法还可以研究复合物中翻译后修饰的动态变化,比如蛋白磷酸化在信号通路中作用。我们已经利用这套方法研究了TNF和LPS信号通路。未来我们会利用这个方法研究更多的信号通路。
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Kunmei Lai, Junjie Wang, Siyi Lin,Zhimin Chen,Guo Lin,Keng Ye, Ying Yuan, Yujiao Lin,Chuan-Qi Zhong,Jianfeng Wu,Huabin Ma,Yanfang Xu
Pengge Qian,Xu Wang,Cuirong Guan, Xin Fang,Mengya Cai,Chuan-qi Zhong, Yong Cui, Yanbin Li,Luming Yao,Huiting Cui,Kai Jiang,Jing Yuan
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